Fundada en 1499 por el cardenal Francisco Jiménez de Cisneros, la Universidad Complutense de Madrid (UCM)  es una universidad pública española con 26 facultades y más de 30 institutos de investigación. Con más de 83.000 estudiantes, es la universidad más grande de España, una institución académica líder en América Latina y una de las universidades más prestigiosas del mundo hispanohablante. Con siete Premios Nobel entre sus profesores y graduados, la UCM también es una de las universidades más destacadas de Iberoamérica.

El KAICIID y la UCM cooperan en proyectos de investigación conjuntos, especialmente en los campos interdisciplinarios de Estudios Religiosos, Estudios para la Paz y Estudios Interreligiosos e Interculturales. La UCM ha contribuido con la elaboración de dos módulos del curso en línea sobre diálogo interreligioso del KAICIID. En julio de 2016, el KAICIID, en cooperación con el Instituto Universitario de Ciencias de las Religiones de la UCM, ofreció el curso “Gobernanza mundial: Diálogo interreligioso y consolidación de la paz” en el marco de los cursos de verano de la UCM en El Escorial. Durante el curso se debatió con expertos académicos y con representantes de diferentes organizaciones internacionales sobre la contribución del diálogo y la religión a la paz. El KAICIID y la UCM también han participado conjuntamente en el XI y el XII Congresos Internacionales organizados por la Sociedad Española de Ciencias de las Religiones y celebrados en Sevilla (2016) y Zaragoza (2018).